泉州市第三医院占地面积6400平方米，建筑面积 12000多平方米。医院始建于1960年2月，隶属民政系统，1974年由民政转为卫生系统管辖，易名为晋江地区精神病防治院，1985年2月改名为晋江地区第三医院，1986年3月随泉州地改市而正名为泉州市第三医院。
医院编制床位370张，实际开放床位430张;全院职工259人，各类技术人员243人，其中高级职称 26人，中级职称71人;年门诊量近二十万人次，年住院人数2000余人次;是福建省规模较大，技术力量较为雄厚、，设备较为齐全的精神疾病专科医院，1998 年在全省首家以整体优势跨入等级，成为三级乙等精神疾病专科医院。
2002年11月经批准成立泉州市心理卫生中心，挂靠泉州市第三医院。2011年2月份经省卫生厅批准设立泉州市精神卫生中心，挂靠我院，赋予我院对全市精神卫生工作的指导及协调管理职责。医院业务科室设置：精神一科(包括戒酒科、中西医结合科)与精神二科(老年精神症科、神经症科、儿童精神科)共五个病区、心理卫生中心、司法精神医学鉴定所、门(急)诊部、康复科、医技各科室、药房等，并设有：精神医学、医学心理学和司法精神医学3个研究室和精神医学教研组一个。主要业务范围：门诊开设有专家门诊、专科特色门诊，为失眠症、癔症、神经症、精神分裂症、抑郁症、人格障碍、癫痫、情绪障碍、老年痴呆、儿童多动症、抽动症、品行障碍和学习困难等提供有效治疗和优质服务。